L'hivernage piscine naturelle commence en octobre-novembre, quand la température de l'eau descend sous 12 °C. Contrairement aux piscines chimiques, il n'est pas nécessaire d'ajouter de produits : coupez simplement la pompe de circulation, retirez et rangez les accessoires de baignade et posez un filet anti-feuilles pour protéger la surface.
La préparation hiver bassin inclut la taille des végétaux : coupez les phragmites et massettes à 20 cm du sol, laissez les plantes oxygénantes immergées en place. La remise en route piscine naturelle au printemps se fait progressivement : redémarrez la pompe quand la température dépasse 10 °C et laissez l'écosystème se réactiver naturellement pendant 4 à 6 semaines.
