Le robot de nettoyage pour piscine naturelle doit etre compatible avec les fonds irreguliers et les membranes souples. Les modeles a aspiration douce conviennent mieux que les robots a surpression qui risquent de deplacer le substrat.
Un aspirateur manuel sur perche reste une alternative efficace pour les petits bassins. Pour les surfaces plus grandes, un robot electrique a faible puissance d'aspiration nettoie le fond et les parois sans endommager la membrane EPDM.