La filtration biologique repose sur l'action combinee des bacteries nitrifiantes et des plantes aquatiques. L'eau circule du bassin de nage vers la zone de regeneration ou elle traverse un substrat de gravier colonise par des micro-organismes benefiques.
Le circuit d'eau est assure par une pompe basse consommation qui fait circuler le volume total du bassin en six a douze heures. Le substrat mineral offre une surface de colonisation importante pour les bacteries qui degradent les matieres organiques.